为控制院内交叉感染，空调通风系统的设计，必须尽可能地使空气从高清洁区流向一般清洁区再流到非清洁区，这是众所周知的原则。

当然维持各区域空气压差所采取的基本手段，无一例外都是靠送风口、回风、排风以及渗漏风等所维持某种状态的动态平衡。

设计与建造工作之所以需要，因为从保证各区域合理的空气压力分布的角度，建筑构造形式，空调方式及调节与控制方法的选取十分关键。某些问题在设计、建造时未给予恰当考虑，运行时则往往很难弥补。例如房间气密性很差，维持房间相对于周围环境必要的空气压差，就比较困难，而且那些无从把握数量的无组织渗漏风，又将干扰其他相邻房间。例如天津某医院在今年四、五月间，根据疫情发展，应急改造为接待SARS患者的隔离医院，由于原有的建筑构造气密性差，尽管空调通风系统风量分布合理，但改造完成调试时，东堵西塞才勉强接近设计所规定的空气压差。又如，在设计时未充分考虑电梯、物品提升装置、楼梯间以及某些交通斜道的影响。在实际运行中由于电梯等运动时引起的活塞风以及竖井的烟囱效应等都会干扰破坏空调系统的气流组织，而且这种干扰往往是无法控制的。因此在设计时，医院电梯、提升机等在楼层的开口应设置前室或设在封闭空间内，再通过送、排风系统和风口的合理布置来减弱这种影响因素。在空气压差不同的区域之间所有连通门的气密性处理十分重要，在关闭时门周边的密封条对维持压差很有用，当门开启、有人及物品车通过时，区域间的压差通常很难保持，但如果门上方设有受压差控制自动开闭的余压阀（air  damper）一类的设置，则可以减弱当开关门时的瞬间气流冲击。对于重症区与其他区域间交接处，则需要设置前室和双道门，或者气阀室（air  lock）。可靠和灵便的风量调节装置及自动控制系统，也是压差与气流流向的重要保障，因为新风、送风、回风、排风通路上都存在某些变数，影响系统各部分的风量，例如过滤器阻力随积尘的变化，表冷器外壁积垢或在不同湿工况下，表面凝水膜层厚薄不同所引起其阻力的变化，以及空调房间开门造成额外泄压等等，都需要靠灵敏的压差传感器、电动执行机构及调节性能优良的风阀及时作出反应。设计时自动控制系统的方式及设备选择显然十分重要。在一般区域或工作人员用房，从节能角度出发，国外常采用变风量系统，目前国内尚不多见，今后应有发展空间。对于医院建筑的VAV系统，国外的经验是特别要注意保证最小风量，要注意送、回、排风的及时跟踪控制，以保证所规定的压力状态。

一个设计完善的空调系统其初调节及日常维护与监测等环节，是其功能充分发挥的基本保证。甚至某些设计缺陷也往往是在初调节时发现，并采取相应措施来弥补的。但目前国内多数空调净化系统施工单位不具备相应的能力：

既无必要的在校验有效期内的仪器设备，又缺乏掌握规范的调试方法与有经验的技术人员；也没有国外由专门的调试检测机构予以认证的机制，如美国NEBB。往往是某些部分明显出现问题，如温、湿度达不到、噪音偏大、洁净度不达标才会想到找第三方予以检测、认证，这是国内目前空调通风系统普遍存在的状况。而从医院控制交叉感染的要求来看，这种情况是不能容忍的。

如前所述医院空调系统在运行过程中，系统各部分的阻力可能有不同规律的变化，相应的风量与各房间压差也会发生波动，因此，空调系统的各部位都应有显示压力、干球温度、湿球温度或相对湿度等相关的仪表供维护运行人员、医护人员随时监测、记录，特别在需要维持压差的相邻房间必须设有微压差计，供管理及使用人员随时检查及时采取措施。如有中央控制室，则风机、水泵、表冷、加湿、过滤设备的运行状态，及主要空调房间的温湿度及压力应能随时巡检、记录和报警，以便及时掌握运行是否正常，以及异常时作出相应干预。如新风机组过滤器因积尘阻力超过规定值，以致新风供给量下降；某些房间的正压值因回风量增多而下降……那么观察到这种情况后，维护人员则应及时更换过滤器或是调节回风量使系统恢复正常。而维护、监测、管理等工作也是目前国内多数医院空调系统日常运行偏于薄弱的环节，缺少专业人员参与，对维护人员的定期培训持证上岗及考核制度也有待健全。